醫管局表示，計劃於2008/09年度耗資17.28億進行將軍澳醫院擴建工程。工程完成後，將軍澳區的病床數目將增加至約600張。工程預計於2009至2010年第一季動工，耗資約17.28億元。
     將軍澳醫院的擴建工程，包括加建病床178張，並在B區停車場新建一座樓高11層的日間醫療服務大樓，大樓可容納現時各個專科門診、日間手術中心、日間醫療中心、內窺鏡檢查部、中醫診所及健康資源中心等，以及將來投入服務的日間精神科病房。新大樓落成後，騰空的舊主座大樓將改建為病房，以及擴充現時不足的設施，包括藥房及化驗室等。整項工程預計於2013年完成。
     另外，瑪麗醫院的急症創傷及心臟護理大樓，預計於2008/09年第三季動工，耗資約18.64億元。