皇崗口岸重建項目新口岸綜合大廈日前動工，專案於2019年6月正式啟動，分三個階段完成:首先在貨檢區建設臨時旅檢場地，其次拆除皇崗口岸片區老舊建築，最後再建設新口岸。目前第一階段工作已經完成，第二、三階段工作同步推進，皇崗口岸是深港之間目前唯一實行24小時通關的陸路口岸，位於深圳市福田區南端，與香港新界落馬洲隔河相望，口岸南面的皇崗-落馬洲大橋橫跨深圳河連接深港兩地。
  建設方案於2019年6月動工；2020年5月臨時旅檢樓完成工程驗收並正式移交。深圳為此口岸型綜合交通樞紐邀請全球機構展開設計競賽。吸引了國內外35個投標聯合體，81家國內外頂尖設計公司參與投標，經過激烈角逐，9家單位入圍。中標單位經過方案深化設計出5個方案，最終以“灣區基石，國之重器”為概念靈感的新口岸設計方案脫穎而出。
  新皇崗口岸規模宏大，新建工程包括新口岸建設工程與口岸綜合辦公樓兩部分：（1）新口岸位於皇崗口岸現狀旅檢區內，占地約8萬平方米，總建築面積約40萬平方米，建設內容暫定包括口岸旅檢大樓、查驗通道、大巴上落客區、重點查驗車場、公共交通接駁層等。 （2）口岸綜合辦公樓位於新建旅檢大樓北側，占地面積約0.65萬平方米，總建築面積約15萬平方米。
  新建後的皇崗口岸將定位為純旅檢口岸，最高每日客流量可達30萬人次，皇崗口岸重建項目預計2022年底建成。